长蕊甜菜育苗地应沿等高线方向布局，有利于排水。育苗地宜选择疏松的砂壤土作为基质，加入50%腐殖土、2%普钙，拌匀，喷洒浓度为2.5%敌杀死乳油2000倍液和50%甲基托布津可湿性粉剂1000~1500倍液或50%多菌灵可湿性粉剂800倍液，堆捂20天左右进行杀虫灭菌。在育苗地沿等高线方向清理出宽为1.5~2.0m的带状育苗墒（床），育苗墒（床）高出自然地表约10cm，将堆捂消毒的营养土装袋放置于墒内备用。甜菜树根系较长，一般苗高与地下根系等长，为防止幼苗过早“穿袋”，应选用直径为10～12cm、高为18~22cm的营养袋，袋内装足配制好的营养土，将已装营养土的育苗袋整齐放置于育苗墒(床）中备用。

总体上，育苗用营养土宜用砂壤土拌和一定量（约占40%）的腐殖土（与甜菜树原生地土壤条件类似），保证营养土既有良好的通气性和潮湿度，营养土能结成团，有利于甜菜树种子萌发和移植。